Zionoco vertelt het verhaal van Sol Mayer, een 42-jarige, succesvolle liberale rabbijn van Nederlandse afkomst die in New York woont. Hij is getrouwd met Naomi en leeft comfortabel binnen de Joodse upperclass. Sol is geliefd om zijn charismatische preken, maar innerlijk voelt hij zich steeds leger. Tijdens een congres wordt hij verliefd op de zangeres Dianne, die hem intrigeert door haar intelligentie en zelfstandigheid. Hun affaire groeit wanneer Naomi tijdelijk naar Europa vertrekt. Tegelijk raakt Sols reputatie beschadigd door een controversieel artikel en door een uitgelekte video van zijn relatie met Dianne, wat leidt tot publieke vernedering.

Sol vlucht naar Suriname, waar hij worstelt met alcohol en herinneringen aan zijn vader. Via terugblikken leert de lezer hoe Sols vader, ook rabbijn, na schandalen verdween en later spoorloos raakte tijdens een zoektocht naar de berg Zionoco. Vastbesloten volgt Sol diens pad. Tijdens een gevaarlijke tocht door het oerwoud slaat zijn kano om en doodt hij uit zelfverdediging zijn gids. Uiteindelijk wordt Sol opgevangen door Indianen die Jiddisch spreken: zijn vader leefde daar en was hun rabbijn geworden. Op de berg Zionoco vindt Sol zijn stervende vader. Na diens dood besluit Sol bij de Indianen te blijven en zijn plaats als rabbijn over te nemen.